Для удаления данных ярлыков пользователям нужно создать групповую политику.
Открываем оснастку Управление групповой политикой далее заходим:
Конфигурация компьютера -> Политики -> Конфигурация Windows -> Параметры безопасности -> Файловая система
Добавляем расположение ярлыков для управления сервера и powershell
%AllUsersProfile%MicrosoftWindowsStart MenuProgramsAdministrative ToolsServer Manager.lnk
%AllUsersProfile%MicrosoftWindowsStart MenuProgramsAccessoriesWindows PowerShellWindows PowerShell.lnk
Выставляем права
На этом все.